RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Компьютерные исследования и моделирование // Архив

Компьютерные исследования и моделирование, 2015, том 7, выпуск 2, страницы 347–359 (Mi crm192)

АНАЛИЗ И МОДЕЛИРОВАНИЕ СЛОЖНЫХ ЖИВЫХ СИСТЕМ

Определение промоторных и непромоторных последовательностей $E.coli$ по профилям их электростатического потенциала

Е. А. Темлякова, А. А. Сорокин

Институт биофизики клетки РАН, Россия, 142290, г. Пущино, ул. Институтская, д. 3

Аннотация: В рамках данной работы была продемонстрирована возможность использования характеристик профилей электростатического потенциала вдоль последовательностей ДНК для определения их функционального класса. Построены модели, позволяющие разделять промоторные и непромоторные последовательности (случайные бернуллиевские, кодирующие и псевдопромоторы) с точностью порядка 83-85 %. Определены наиболее значимые участки для такого разделения, по-видимому играющие важную роль при ДНК-полимеразном узнавании.

Ключевые слова: электростатические свойства ДНК, поиск промоторов, VIP-анализ.

УДК: 519.8

Поступила в редакцию: 16.09.2013
Исправленный вариант: 26.01.2015

DOI: 10.20537/2076-7633-2015-7-2-347-359



© МИАН, 2024