RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Компьютерные исследования и моделирование // Архив

Компьютерные исследования и моделирование, 2014, том 6, выпуск 5, страницы 719–745 (Mi crm355)

Эта публикация цитируется в 2 статьях

АНАЛИЗ И МОДЕЛИРОВАНИЕ СЛОЖНЫХ ЖИВЫХ СИСТЕМ

Неполные системы линейных уравнений с ограничениями на переменные

И. Г. Минкевич

ФГБУН «Институт биохимии и физиологии микроорганизмов им. Г. К. Скрябина РАН», Россия, 142290, г. Пущино, Московская обл., просп. Науки, д. 5

Аннотация: Сформулирована задача описания объектов различной природы на основе системы линейных уравнений, в которой число неизвестных превосходит число уравнений. Важной особенностью такой задачи, существенно усложняющей ее решение, являются ограничения на значения ряда переменных. Примером такой задачи является выбор биохимических реакций, осуществляющих преобразование заданного субстрата (исходного вещества) в заданный продукт. В этом случае неизвестными являются скорости биохимических реакций, образующие искомый вектор решения. Компоненты этого вектора в описываемом подходе разделяются на две группы: 1) задаваемые, $\vec y$; 2) зависящие от задаваемых, $\vec x$. Изучены варианты конфигурации области допустимых значений $\vec y$, следующие из ограничений, наложенных на компоненты $\vec x$. Выявлено, что часть ограничений могут быть излишними и поэтому исключенными из рассмотрения, что упрощает решение задачи. Анализируются случаи, когда два или более ограничений на $\vec x$ приводят к появлению жестких связей между компонентами $\vec y$. Описаны методы поиска базисных решений, учитывающие особенности данной задачи. Постановка общей задачи и полученные решения проиллюстрированы биохимическим примером.

Ключевые слова: линейные уравнения, прямоугольные матрицы, линейные неравенства, стехиометрия метаболизма, метаболические пути.

УДК: 519.7

Поступила в редакцию: 16.07.2014
Исправленный вариант: 10.10.2014

DOI: 10.20537/2076-7633-2014-6-5-719-745



© МИАН, 2024