RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Компьютерные исследования и моделирование // Архив

Компьютерные исследования и моделирование, 2011, том 3, выпуск 1, страницы 85–92 (Mi crm550)

АНАЛИЗ И МОДЕЛИРОВАНИЕ СЛОЖНЫХ ЖИВЫХ СИСТЕМ

Компьютерный анализ первичных структур инулиназ из различных продуцентов

М. Г. Холявка, Т. А. Ковалева, Е. А. Хрупина, В. Г. Артюхов

Воронежский государственный университет Россия, 394006, Воронеж, Университетская площадь, д. 1

Аннотация: Установлено, что основное количество гомологичных звеньев у инулиназ из различных продуцентов представлено остатками Gln, Asn и Glu. Карбоксильные группы боковых радикалов Asp и Glu, входящих в состав активных центров инулиназ, могут играть роль контактных групп для молекул субстрата, а также осуществлять кислотно-основный катализ. Сопоставление первичных структур инулиназ показало, что частота замен остатков на протяжении полипептидных цепей отличается высокой вариабельностью. Построено филогенетическое дерево инулиназ из различных источников. Выявлено, что высокая степень гомологии характерна для ферментов из Aspergillus awamori, Aspergillus niger и Aspergillus ficuum. Показано, что относительно небольшим родством обладают эндо- и экзоинулиназы.

Ключевые слова: инулиназа, первичная структура, компьютерный анализ.

УДК: 577.325

Поступила в редакцию: 22.02.2011

DOI: 10.20537/2076-7633-2011-3-1-85-92



© МИАН, 2024