RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Компьютерные исследования и моделирование // Архив

Компьютерные исследования и моделирование, 2011, том 3, выпуск 2, страницы 191–213 (Mi crm559)

Эта публикация цитируется в 9 статьях

АНАЛИЗ И МОДЕЛИРОВАНИЕ СЛОЖНЫХ ЖИВЫХ СИСТЕМ

Моделирование пространственно-временной динамики циркадианных ритмов Neurospora crassa

Д. А. Брацун, А. П. Захаров

Пермский государственный педагогический университет, Россия, 614600, г. Пермь, ул. Сибирская, д. 24

Аннотация: В работе предложена новая модель циркадианных колебаний нейроспоры, которая описывает пространственно-временную динамику белков, ответственных за механизм биоритмов. Модель основывается на нелинейном взаимодействии белков FRQ и WCC , кодируемых генами frequency и white collar, и включает в себя как положительную, так и отрицательную петлю обратной связи. Главным элементом механизма колебаний является эффект запаздывания в биохимических реакциях транскрипции генов. Показано, что модель воспроизводит такие свойства циркадианных колебаний нейроспоры как захват частоты под действием внешнего периодического освещения, сброс фазы биоритмов при воздействии импульса света, устойчивость механизма колебаний по отношению к случайным флуктуациям и т. д. Исследованы волновые структуры, возникающие в ходе пространственной эволюции системы. Показано, что волны синхронизации биоритмов среды возникают под воздействием базального транскрипционного фактора.

Ключевые слова: запаздывание, стохастические системы, циркадианные ритмы, генная регуляция.

УДК: 517.958:57

Поступила в редакцию: 25.05.2011
Исправленный вариант: 11.06.2011

DOI: 10.20537/2076-7633-2011-3-2-191-213



© МИАН, 2024