RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Компьютерные исследования и моделирование // Архив

Компьютерные исследования и моделирование, 2010, том 2, выпуск 1, страницы 73–81 (Mi crm581)

Эта публикация цитируется в 1 статье

АНАЛИЗ И МОДЕЛИРОВАНИЕ СЛОЖНЫХ ЖИВЫХ СИСТЕМ

Исследование механических свойств иммуноглобулинсвязывающих доменов белков L и G методом молекулярной динамики

А. В. Глякинаa, О. В. Галзитскаяb, Н. К. Балабаевa

a Учреждение Российской академии наук Институт математических проблем биологии РАН, 142290, Московская обл., г. Пущино, ул. Институтская, д. 4
b Учреждение Российской академии наук Институт белка РАН, 142290, Московская обл., г. Пущино, ул. Институтская, д. 4

Аннотация: Механическое разворачивание под действием внешних сил двух похожих по пространственной структуре, но отличающихся по аминокислотной последовательности иммуноглобулинсвязывающих доменов белков L и G исследуется методом молекулярной динамики с использованием явной модели растворителя. Рассчитаны механические характеристики этих белков. Показано, что на пути механического разворачивания обоих белков появляются промежуточные состояния. Проведенные расчеты выявили три существенно различающихся пути механического разворачивания белков L и G.

Ключевые слова: молекулярная динамика, механическое разворачивание, контакты между элементами вторичной структуры.

УДК: 537.2:544.272

Поступила в редакцию: 17.03.2010

DOI: 10.20537/2076-7633-2010-2-1-73-81



© МИАН, 2024