RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Компьютерные исследования и моделирование // Архив

Компьютерные исследования и моделирование, 2010, том 2, выпуск 1, страницы 91–101 (Mi crm583)

Эта публикация цитируется в 1 статье

АНАЛИЗ И МОДЕЛИРОВАНИЕ СЛОЖНЫХ ЖИВЫХ СИСТЕМ

Применение методов кластерного анализа к исследованию множества допустимых решений фазовой проблемы биологической кристаллографии

О. В. Соболев, Н. Л. Лунина, В. Ю. Лунин

Учреждение Российской академии наук Институт математических проблем биологии РАН, 142290, Московская обл., г. Пущино, ул. Институтская, д. 4

Аннотация: Рентгеновский дифракционный эксперимент позволяет определить значения модулей комплексных коэффициентов в разложении в ряд Фурье функции, описывающей распределение электронов в исследуемом объекте. Определение недостающих значений фаз коэффициентов Фурье представляет центральную проблему метода. Результатом применения некоторых подходов к решению фазовой проблемы является множество допустимых решений. Методы кластерного анализа позволяют исследовать структуру этого множества и выделить одно или несколько характерных решений. Существенной особенностью описываемого подхода является то, что близость решений оценивается не по их формальным параметрам, а на основе корреляции предварительно выровненных синтезов Фурье электронной плотности, рассчитанных с использованием сравниваемых наборов фаз. Предлагаемый метод исследования реализован в виде интерактивной программы ClanGR.

Ключевые слова: биологическая кристаллография, фазовая проблема, кластерный анализ.

УДК: 543.442.3:548.73

Поступила в редакцию: 05.03.2010

DOI: 10.20537/2076-7633-2010-2-1-91-101



© МИАН, 2024