RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Препринты Института прикладной математики им. М. В. Келдыша РАН // Архив

Препринты ИПМ им. М. В. Келдыша, 2018, 059, 24 стр. (Mi ipmp2421)

Эта публикация цитируется в 3 статьях

Анализ площадей и периметров полигонов пересечения проекций спиралей в спиральных парах белковых молекул

Д. А. Тихонов, Л. И. Куликова, А. В. Ефимов


Аннотация: В данной работе проведен анализ распределения площадей и периметров полигонов пересечения проекций спиралей в парах связанных между собой перетяжками спиралей в пространственных структурах белковых молекул. Исследование проводилось на множестве спиральных пар, отобранных нами согласно разработанным правилам из структур белковых молекул, представленных в PDB. Показано, что спиральные пары всех типов, принадлежащие подмножеству пар, имеющих пересечение проекций спиралей, но не имеющих пересечения осей спиралей, имеют площади и периметры полигонов пересечения, значения которых малы или близки к нулю. Среди всех типов спиральных пар, принадлежащих подмножеству пар, имеющих пересечение проекций и осей спиралей, нет пар, имеющих малые или близкие к нулю значения площадей и периметров полигонов пересечения проекций спиралей. Максимум распределения пар, образованных двумя $\alpha$-спиралями и принадлежащих данному подмножеству, отмечен при значениях площадей и периметров полигонов пересечения проекций спиралей, лежащих в области от 70 Å до 150 Å и в области от 30 Å до 45 Å, соответственно.

Ключевые слова: структурные мотивы, точечная модель, спиральные пары в белковых молекулах, площадь и периметр полигона пересечения проекций спиралей.

DOI: 10.20948/prepr-2018-59



Реферативные базы данных:


© МИАН, 2024