RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Известия Саратовского университета. Новая серия. Серия: Физика // Архив

Изв. Сарат. ун-та. Нов. cер. Сер. Физика, 2021, том 21, выпуск 4, страницы 315–328 (Mi isuph9)

Эта публикация цитируется в 1 статье

Биофизика и медицинская физика

Интерференция GB-спеклов в молекулярной дискриминации бактериальных патогенов: использование метода s-LASCA на модели Chlamydia psittaci

С. С. Ульяновab, О. В. Ульяноваa, С. С. Зайцевb, Ю. В. Салтыковb, А. С. Ульяновc, В. А. Федороваab

a Саратовский национальный исследовательский государственный университет им. Н. Г. Чернышевского
b Федеральный исследовательский центр вирусологии и микробиологии, филиал в Саратове
c Люксофт Дубна, Россия, 141983, г. Дубна, ул. Программистов, д. 4

Аннотация: Продемонстрировано, как виртуальные оптические спеклы (GB-спеклы) могут быть сформированы из нуклеотидных последовательностей семи генов домашнего хозяйства Chlamydia psittaci. Изучены специфические особенности формирования интерференционных картин при суперпозиции как исходных GB-спеклов, так и GB-спеклов, прошедших обработку методом анализа контраста лазерных спеклов (s-LASCA). Показано, что контраст интерферирующих GB-спеклов может быть использован для выявления полиморфизма у нуклеотидных последовательностей бактериальных патогенов, используемых для мультилокусного типирования.

Ключевые слова: виртуальные оптические спеклы (GB-спеклы), метод анализа контраста лазерных спеклов (s-LASCA), биоинформатика, Chlamydia psittaci, мультилокусное типирование.

УДК: 577.32

Поступила в редакцию: 09.08.2021

DOI: 10.18500/1817-3020-2021-21-4-315-328



© МИАН, 2024