Exact sequence matches in genomic studies

Цель этого обзора - рассмотреть использование точных соответствий геномных последовательностей в разных контекстах. Методы. Здесь представлен явно не исчерпывающий список работ, в которых авторы добились интерпретируемых результатов, используя статистические данные точных соответствий разных геномных последовательностей или самосоответствий на одном геноме. Результаты. Часто в геномных исследованиях разные геномные локусы обладают различными статистическими свойствами, в то время как их границы изначально не известны. В таких случаях рассмотрение статистических свойств точных соответствий является полезной альтернативой других методик, например основывающихся на разделении генома на произвольного размера участки - так называемые скользящие или нескользящие окна. Заключение. Этот обзор демонстрирует, что анализ точных соответствий это не только вспомогательный шаг в выравнивании геномных последовательностей, но также выявляет биологические закономерности в различных контекстах.