RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Известия Кабардино-Балкарского научного центра РАН // Архив

Известия Кабардино-Балкарского научного центра РАН, 2017, выпуск 6-2, страницы 124–128 (Mi izkab228)

ИНФОРМАТИКА. ВЫЧИСЛИТЕЛЬНАЯ ТЕХНИКА. УПРАВЛЕНИЕ

Автоматизация подсчета генетического сходства и генетических дистанций

М. А. Казаковab

a ФГБУ ВО «Кабардино-Балкарский государственный университет им. Х.М. Бербекова», 360004, КБР, г. Нальчик, ул. Чернышевского, 173
b Институт прикладной математики и автоматизации – филиал ФГБНУ «Федеральный научный центр «Кабардино-Балкарский научный центр Российской академии наук», 36000, КБР, г. Нальчик, ул. Шортанова, 89-а

Аннотация: Построение филогенетических деревьев является важнейшей задачей в биологических исследованиях. В рамках этого предмета исследования возникает проблема автоматизации вычисления генетического расстояния и генетического сходства между популяциями одного вида. Объектом исследования являются последовательности аллелей в локусах политенных хромосом. В статье представлена программа Chironomus, написанная на языке C#, позволяющая быстро и удобно проводить расчеты генетической дистанции по всем основным методам. Разработанная программа существенно упрощает генетические исследования, позволяя достаточно просто вводить данные и получать результаты одновременно для большого числа сравниваемых популяций.

Ключевые слова: автоматизация вычисления, генетическая дистанция, генетическое сходство, хирономиды, Chironomus, политенные хромосомы.

УДК: 519.68

Поступила в редакцию: 23.11.2017



© МИАН, 2024