Solving of the biological kinetics problem on a heterogeneous multiprocessor computer system

Описан процесс решения задачи биологической кинетики, сводящейся к численному решению трехмерного уравнения диффузии-конвекции. Решение сеточных уравнений, полученных в результате дискретизации непрерывной модели, выполняется на основе адаптивного попеременно-треугольного метода. Рассматриваемая задача была численно реализована на вычислительной системе с распределенной памятью, рассчитанной на массивно параллельные вычисления, что позволило значительно сократить время работы программного модуля. Проведенное исследование модели параллельных расчетов на GPU для последовательности сгущающихся сеток при разном количестве потоков позволило разработать оптимальный режим работы параллельных алгоритмов при разном объеме входных данных. Приведено описание программной реализации математической модели, адаптированной для гибридных компьютерных систем.