RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Письма в Журнал экспериментальной и теоретической физики // Архив

Письма в ЖЭТФ, 2022, том 115, выпуск 12, страницы 811–818 (Mi jetpl6700)

Эта публикация цитируется в 5 статьях

БИОФИЗИКА

Влияние активного выпетливания на статистику тройных контактов в модели интерфазных хромосом

С. А. Беланab, Д. Е. Старковab

a Национальный исследовательский университет Высшая школа экономики, факультет физики, 101000 Москва, Россия
b Институт теоретической физики им. Л. Д. Ландау РАН, 142432 Черноголовка, Россия

Аннотация: Теоретически исследуется статистика тройных контактов между участками интефазной хромосомы в присутствии механизма активного выпетливания. Моделируя хроматин как идеальную полимерную цепь с вмороженным беспорядком случайных петель, мы находим в рамках однопетлевого приближения выражение для условной вероятности контакта между двумя участками цепи при наличии дополнительного контакта с третьим участком. Анализ полученного выражения показывает нарушение механизмом выпетливания масштабной инвариантности, марковости и гауссовости идеальной цепи, подсказывая пути извлечения характеристик процесса выпетливания из экспериментальных данных касательно частот кратных контактов в интерфазных хромосомах. Кроме того, результаты работы свидетельствуют об ограниченности широко распространенных гауссовых полимерных моделей в вопросе воспроизведения некоторых особенностей конформационной статистики хромосом.

Поступила в редакцию: 02.05.2022
Исправленный вариант: 09.05.2022
Принята в печать: 09.05.2022

DOI: 10.31857/S1234567822120102


 Англоязычная версия: Journal of Experimental and Theoretical Physics Letters, 2022, 115:12, 763–769


© МИАН, 2024