RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Журнал Сибирского федерального университета. Серия «Математика и физика» // Архив

Журн. СФУ. Сер. Матем. и физ., 2024, том 17, выпуск 6, страницы 808–816 (Mi jsfu1214)

Structure determination of the Pb$^{2+}$-specific GT aptamer using SAXS and molecular modeling methods

[Определение структуры аптамера GT, специфичного к ионам свинца (II), методами МУРР и молекулярного моделирования]

Polina V. Artyushenkoab, Irina A. Shchugorevaab, Anna N. Berlinac, Nadezhda S. Komovac, Kseniya V. Serebrennikovac, Roman V. Moryachkova, Vladimir N. Zabludad, Alexey E. Sokolovde, Felix N. Tomilinade, Anna S. Kichkailoab

a Federal Research Center KSC SB RAS, Krasnoyarsk, Russian Federation
b Prof. V. F. Voino-Yasenetsky Krasnoyarsk State Medical University, Krasnoyarsk, Russian Federation
c A. N. Bach Institute of Biochemistry, Research Center of Biotechnology RAS, Moscow, Russian Federation
d Kirensky Institute of Physics, Federal Research Center KSC SB RAS, Krasnoyarsk, Russian Federation
e Siberian Federal University, Krasnoyarsk, Russian Federation

Аннотация: Аптамер GT, конъюгированный с золотыми наночастицами, специфичен к ионам тяжёлых металлов и может использоваться для контроля качества воды и экологического мониторинга. Для определения структуры комплекса аптамера с ионами свинца (II) были проведены измерения кругового дихроизма (КД) и малоуглового рентгеновского рассеяния (МУРР). Сопоставление результатов измерений с разными вариантами пространственной структуры комплексов, полученными с помощью молекулярного моделирования, позволило определить, как меняется конформация аптамера при взаимодействии с мишенью — ионами свинца (II).

Ключевые слова: аптамеры, ионы тяжелых металлов, малоугловое рентгеновское рассеяние, спектроскопия кругового дихроизма, молекулярное моделирование.

УДК: 54.182; 546.55; 538.958

Получена: 10.08.2024
Исправленный вариант: 16.09.2024
Принята: 20.10.2024

Язык публикации: английский



© МИАН, 2024