Метод поиска пиков размерного стандарта при фрагментном анализе ДНК

Фрагментный анализ ДНК методом капиллярного гель-электрофореза является эффективным инструментом изучения структуры ДНК, имеющим множество областей применения, в частности для генетической экспертизы сортов и сортообразцов ряда важнейших сельскохозяйственных культур. Фрагментный анализ ДНК проводится в несколько этапов. Этап обработки результатов исследования включает процедуру обнаружения пиков стандартных фрагментов ДНК. В работе перечислены особенности спектра распределения стандартных фрагментов ДНК, приводящие к необходимости разработки нового метода поиска пиков стандарта. Предложен метод их поиска, основанный на сопоставлении совокупности стандартных длин фрагментов ДНК и спектральных пиков. Описан алгоритм, реализующий этот метод. Также подробно рассмотрен критический этап алгоритма – выбор порога для процедуры обнаружения пиков в спектре. Перечислены достоинства и недостатки метода, приведены результаты тестирования.