Математическое моделирование линейного докинга. II. Определение влияния точечных мутаций на сродство между белковыми молекулами

Представлен новый метод, который позволяет качественно определять константу диссоциации пептидов к полноразмерным белкам, а также устанавливать влияние точечных мутаций в пептидах на устойчивость образованного комплекса с целыми белками. На основе разработанного подхода была выявлена качественная корреляция полученных результатов с константой диссоциации на примере образования биологического комплекса BH3-пептидов белков Bmf, Puma, Bad, Hrk, Bax, Bik, Noxa, Bid, Bim, Bak с белком Bcl-xl и BH3-пептидов белка Bax, с учетом замен аминокислотных остатков, с белком Bcl-2.