Аннотация:
Рассматривается нелинейная модель данных ДНК-микрочипов, в которой интенсивность флуоресценции проб описывается функцией Лэнгмюра. Разработан метод настройки параметров модели на основе общедоступных данных нескольких тысяч экспериментов, основанный на минимизации функции потерь из класса AB-дивергенций; для выбора оптимальных значений гиперпараметров проведены численные эксперименты. Полученная модель описывает интенсивности флуоресценции проб микрочипа точнее стандартной линейной, а полученные на её основе оценки экспрессии более устойчивы.
Ключевые слова:ДНК-микрочипы, суммаризация, модель Лэнгмюра, AB-дивергенция.
УДК:519.254
Материал поступил в редакцию 02.10.2012, опубликован 25.10.2012