Е. Ф. Баулин, Т. В. Астахова, М. А. Ройтберг, “Классификация элементов вторичной структуры РНК”, Матем. биология и биоинформ., 2012, том 7, выпуск 2,страницы 567

Биоинформатика

Классификация элементов вторичной структуры РНК

Е. Ф. Баулин^ab, Т. В. Астахова^a, М. А. Ройтберг^a

^a Институт математических проблем биологии, Российская академия наук, Пущино, Московская область, Институтская, 4, 142290, Россия
^b НИУ Высшая школа экономики, Москва, Мясницкая 20, 101990, Россия

Аннотация: Предложена классификация элементов вторичной структуры РНК, которая является обобщением классификации петель, предложенной Мэтьюзом и Тернером. Эта классификация позволяет единообразно описывать структуры как содержащие, так и не содержащие псевдоузлы.

Ключевые слова: РНК, вторичная структура, спираль, псевдоузел, петля.

УДК: 577.214.5

Материал поступил в редакцию 22.10.2012, опубликован 26.10.2012