А. С. Гуменюк, Н. Н. Поздниченко, И. Н. Родионов, С. Н. Шпынов, “О средствах формального анализа строя нуклеотидных цепей”, Матем. биология и биоинформ., 2013, том 8, выпуск 1,страницы 373

Эта публикация цитируется в 6 статьях

Материалы IV Международной конференции «Математическая биология и биоинформатика»

О средствах формального анализа строя нуклеотидных цепей

А. С. Гуменюк^a, Н. Н. Поздниченко^a, И. Н. Родионов^a, С. Н. Шпынов^b

^a Омский государственный технический университет, Омск, 644050, Россия
^b ФБУН «Омский НИИ природно-очаговых инфекций» Роспотребнадзора, Омск, 644080, Россия

Аннотация: Объектом исследования в данной работе является числовая последовательность, отображающая отдельную нуклеотидную цепь, названная строем и формально представляющая взаимное расположение компонентов последовательности ДНК. Сформулированы выражения для числовых характеристик, которые характеризуют порядок элементов цепи. Продемонстрированы некоторые возможности применения этих числовых характеристик для решения задач таксономии организмов, их сравнения, сегментации ДНК и отображения её локальной структуры.

Ключевые слова: количество информации, энтропия, строй цепи элементов, расположение, интервал, числовые характеристики строя цепи, удаленность, регулярность, нуклеотидная цепь, строй, строй нуклеотидной цепи, рибонуклеиновая кислота, рибосомальная РНК, митохондриальная РНК.

УДК: 004.8:575

Материал поступил в редакцию 21.02.2013, опубликован 30.06.2013