М. Б. Чалей, В. А. Кутыркин, “Распознавание скрытой периодичности в последовательностях ДНК”, Матем. биология и биоинформ., 2013, том 8, выпуск 2,страницы 502

Эта публикация цитируется в 3 статьях

Биоинформатика

Распознавание скрытой периодичности в последовательностях ДНК

М. Б. Чалей^a, В. А. Кутыркин^b

^a Институт математических проблем биологии, Российская академия наук, Пущино, Московская область, 142290, Россия
^b Московский государственный технический университет им. Н. Э. Баумана, Москва, 107005, Россия

Аннотация: На основе разработанного ранее спектрально-статистического подхода предложены прямые методы распознавания нового типа периодичности в последовательности ДНК — скрытой профильной периодичности, обобщающей известное понятие размытого тандемного повтора. Проведено сравнение предлагаемых методов с другими подходами, опирающимися только на косвенные признаки наличия скрытой периодичности в последовательности ДНК.

Ключевые слова: размытый тандемный повтор, скрытая профильная периодичность, статистический анализ текстовой структуры последовательности ДНК.

УДК: 577.2:519.23

Материал поступил в редакцию 16.08.2013, опубликован 24.09.2013