RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Математическая биология и биоинформатика // Архив

Матем. биология и биоинформ., 2007, том 2, выпуск 1, страницы 48–59 (Mi mbb16)

Материалы Международной конференции «Математическая биология и биоинформатика»

Стехиометрический анализ биохимических систем на графах. II. Графовые образы балансных соотношений

Г. Л. Ермаков

Институт теоретической и экспериментальной биофизики РАН, г. Пущино

Аннотация: Рассмотрено применение графических правил нахождения балансных соотношений (линейных интегралов движения), кинетических уравнений биохимических систем. На простых примерах гипотетических реакций показано, что представление сложной реакции/метаболической сети в виде связного ориентированного двудольного графа и использование его свойств позволяет выявлять вещества, связанные балансными соотношениями, и сформулировать графовые критерии их существования. Показано, что графовыми образами балансных соотношений в графе открытой биохимической системы являются подграфы в виде либо простых и/или сложных циклов, либо в виде совокупности простых и/или сложных циклов и соединяющих их мостов.

Ключевые слова: графы, стехиометрический анализ, балансные соотношения.

УДК: 577.151.01

Материал поступил в редакцию 14.03.2007, опубликован 24.04.2007



© МИАН, 2024