Матем. биология и биоинформ.,
2014, том 9, выпуск 2,страницы 386–395(Mi mbb186)
Биоинформатика
Выявление связи «структура — биологическая активность» на основе конформационного анализа стереоизомеров брассиностероидов методами молекулярного моделирования
Аннотация:
Методами молекулярной механики и квантовой химии в приближении теории функционала плотности проведен конформационный анализ одного из наиболее биологически активных соединений класса брассиностероидов — природного брассинолида, — и менее активных — природного 24-эпибрассинолида, синтетических (22S,23S)-24-эпибрассинолида и (22S,23S)-гомобрассинолида с последующим сопоставлением структур их боковых цепей. Установлено, что конфигурация 22R,23R,24S двух гидроксилов и метильной группы брассинолида обеспечивает структуры боковой цепи, в которых ее диольная система образует внутримолекулярную водородную связь O6…H(O5). При этом гидроксил О6Н свободен и может участвовать в формировании межмолекулярных водородных связей с рецептором. Напротив, 22S,23S,24R-конфигурация наименее биоактивного (22S,23S)-24-эпибрассинолида отвечает структурам боковой цепи, в которых гидроксил О6Н экранирован 21-метил группой. Показано, что важным фактором высокой биоактивности брассиностероидов также является изогнутость их боковой цепи по направлению к $\beta$-стороне остова стероида.