RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Математическая биология и биоинформатика // Архив

Матем. биология и биоинформ., 2014, том 9, выпуск 2, страницы 386–395 (Mi mbb186)

Биоинформатика

Выявление связи «структура — биологическая активность» на основе конформационного анализа стереоизомеров брассиностероидов методами молекулярного моделирования

В. М. Андриановa, И. В. Анищенкоb

a Институт физики им. Б. И. Степанова, Национальная академия наук Беларуси, Минск, 220072, Республика Беларусь
b Объединенный институт проблем информатики, Национальная академия наук Беларуси, Минск, 220012, Республика Беларусь

Аннотация: Методами молекулярной механики и квантовой химии в приближении теории функционала плотности проведен конформационный анализ одного из наиболее биологически активных соединений класса брассиностероидов — природного брассинолида, — и менее активных — природного 24-эпибрассинолида, синтетических (22S,23S)-24-эпибрассинолида и (22S,23S)-гомобрассинолида с последующим сопоставлением структур их боковых цепей. Установлено, что конфигурация 22R,23R,24S двух гидроксилов и метильной группы брассинолида обеспечивает структуры боковой цепи, в которых ее диольная система образует внутримолекулярную водородную связь O6…H(O5). При этом гидроксил О6Н свободен и может участвовать в формировании межмолекулярных водородных связей с рецептором. Напротив, 22S,23S,24R-конфигурация наименее биоактивного (22S,23S)-24-эпибрассинолида отвечает структурам боковой цепи, в которых гидроксил О6Н экранирован 21-метил группой. Показано, что важным фактором высокой биоактивности брассиностероидов также является изогнутость их боковой цепи по направлению к $\beta$-стороне остова стероида.

Ключевые слова: брассиностероиды, конформеры, биологическая активность, конформационный анализ, боковая цепь, водородная связь, компьютерное моделирование.

УДК: 54.022:577.175.1

Материал поступил в редакцию 23.09.2014, опубликован 11.11.2014



© МИАН, 2024