RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Математическая биология и биоинформатика // Архив

Матем. биология и биоинформ., 2014, том 9, выпуск 2, страницы 527–533 (Mi mbb194)

Эта публикация цитируется в 1 статье

Биоинформатика

Предсказание генов маркеров агрессивности глиомы низкой степени злокачественности по экспрессионным данным TCGA

Н. В. Иванисенкоab, Н. В. Губановаab, Н. А. Колчановb, В. А. Иванисенкоb

a Новосибирский Государственный Университет, Новосибирск, 630090, Россия
b Институт цитологии и генетики Сибирского отделения РАН, Новосибирск, 630090, Россия

Аннотация: Глиома низкой степени злокачественности (ГНСЗ) представляет собой группу опухолей ЦНС. В отличие от других злокачественных субтипов, таких как мультиформная глиобластома, глиомы низкой степени злокачественности имеют более низкую смертность. Однако после первичного лечения ГНСЗ наблюдается около 40% случаев повторного образования опухолей. В данной работе с использованием RNA-seq данных из базы данных The Cancer Genome Atlas (TCGA) был проведен поиск генов, ответственных за агрессивный фенотип опухолей. Было обнаружено 85 генов, нарушение в уровне экспрессии которых ассоциировано с появлением новых опухолей после первичного лечения.

Ключевые слова: глиома низкой степени злокачественности (ГНСЗ), глиома, RNA-seq, агрессивность, TCGA.

УДК: 577.21:577.29:004.42

Материал поступил в редакцию 27.11.2014, опубликован 18.12.2014



© МИАН, 2024