RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Математическая биология и биоинформатика // Архив
Матем. биология и биоинформ., 2015, том 10, выпуск 1, страницы 54–59 (Mi mbb211)
Биоинформатика

Стемовые мультиплеты: новый подход к описанию третичных мотивов РНК

Е. Ф. Баулинabc, М. А. Ройтбергcda

a Институт математических проблем биологии, Российская академия наук, Пущино, Московская область, 142290, Россия
b Учебный центр математической биологии, Пущинский государственный естественно-научный институт, Пущино, Московская область, 142290, Россия
c Факультет компьютерных наук, Национальный исследовательский университет «Высшая школа экономики», Москва, 101000, Россия
d Московский физико-технический институт, Долгопрудный, Московская область, 141700, Россия

Аннотация: В работе предлагается подход к описанию сложных фрагментов третичной структуры РНК, основанный на понятии стемовых мультиплетов, т. е. элементов структуры, образованных двумя и более стемами. С помощью базы данных структур РНК (http://server3.lpm.org.ru/urs/) составлен список всех стемовых мультиплетов, встречающихся в базе данных PDB.

Ключевые слова: пространственная структура РНК, мультиплет, стем, псевдоузел, линк, граф.

УДК: 577.214.5

Материал поступил в редакцию 28.11.2014, опубликован 06.02.2015

DOI: 10.17537/2015.10.54


© МИАН, 2024