RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Математическая биология и биоинформатика // Архив

Матем. биология и биоинформ., 2015, том 10, выпуск 1, страницы 116–130 (Mi mbb215)

Эта публикация цитируется в 4 статьях

Биоинформатика

A search for relict ribonucleotide and amino acid sequences that played a key role in the development of the ribosome and modern protein diversity

[Поиск реликтовых рибонуклеотидных и аминокислотных последовательностей, игравших ключевую роль в формировании рибосомы и современного разнообразия белков]

N. E. Skoblikova, A. A. Ziminb

a North Caucasian Research Institute of Animal Husbandry, Krasnodar, Russia
b G. K. Skryabin Institute of Biochemistry and Physiology of Microorganisms, Russian Academy of Sciences, Pushchino, Moscow region, Russia

Аннотация: Представлены результаты анализа базы данных белковых последовательностей прокариотических микроорганизмов, выявившего наличие элементов консервативной пептидной последовательности длиной 11 аминокислотных остатков в 20 локусах 16 функционально и филогенетически различных консервативных белков у представителей различных таксонов. Этот аминокислотный мотив IKAVRELGLER, возможно, является одним из последних общих предшественников матрично-синтезируемых пептидов (Last Universal Peptide Ancestors, LUPA). Источником генетической информации такой последовательности, по всей вероятности, служит фрагмент рибосомной РНК (участок A-сайта, включающий ветви H92, H90 и H93 пептидил-трансферазного центра), транслированный с одной из возможных рамок считывания. Такой фрагмент рРНК, исполнявший функцию матрицы для синтеза LUPA, назван нами последним общим РНК-предшественником (Last Universal RiboNucleic Ancestor, LURNA). Предполагается, что LURNA и транслируемые с него пептидные продукты послужили источником формирования современного разнообразия пептидов.

Ключевые слова: рибосома, рибосомная РНК, трансляция, пептидил-трансферазный центр, универсальный пептидный мотив, Last Universal Peptide Ancestor, LUPA, Last Universal RiboNucleic Ancestor, LURNA.

УДК: 577.217.347

Материал поступил в редакцию 30.03.2015, опубликован 08.04.2015

Язык публикации: английский

DOI: 10.17537/2015.10.116



© МИАН, 2024