RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Математическая биология и биоинформатика // Архив

Матем. биология и биоинформ., 2015, том 10, выпуск 2, страницы 387–397 (Mi mbb233)

Эта публикация цитируется в 1 статье

Биоинформатика

Структурно-статистические свойства кодирующих районов ДНК

В. А. Кутыркинa, М. Б. Чалейb

a Московский государственный технический университет имени Н. Э. Баумана, Москва, Россия
b Институт математических проблем биологии, Российская академия наук, Пущино, Московская область, Россия

Аннотация: С помощью спектрально-статистического подхода (2С-подхода) в работе исследуются структурно-статистические свойства кодирующих последовательностей ДНК (CDS) генома человека, к которым относятся свойство 3-регулярности и скрытая профильная периодичность. Особая значимость и объективное существование этих свойств подтверждаются исследованием бинарно перекодированных CDS. Только один вид вырожденной бинарной перекодировки, соответствующий отождествлению комплементарных нуклеотидов, способствует сохранению свойств исходных CDS. Использование невырожденной бинарной перекодировки подтверждает, что скрытая триплетная периодичность в CDS генома человека относится к ранее неизвестному типу профильной периодичности.

Ключевые слова: скрытая профильная периодичность, спектрально-статистический подход, свойство 3-регулярности CDS, триплетная периодичность.

УДК: 577.2:519.23

Материал поступил в редакцию 03.09.2015, опубликован 02.10.2015

DOI: 10.17537/2015.10.387



© МИАН, 2024