Случайные блуждания по псевдоспецифическим состояниям как модель облегченной диффузии ДНК-связывающего белка

Рассматривается облегченная диффузия регуляторного белка в процессе поиска специфического сайта-мишени на молекуле ДНК. На основе гипотезы о баллистическом движении между рассеяниями на псевдоспецифических участках предложена феноменологическая модель одномерного движения белка. Сочетание этого подхода с моделью дискретных случайных блужданий позволила получить зависимости среднего времени первого достижения от энергии связи, среднего пробега между псевдоспецифическими состояниями, скорости белка и температуры. Выявлены температурный и энергетический оптимумы, при которых достигаются минимальные значения среднего времени поиска.