RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Математическая биология и биоинформатика // Архив

Матем. биология и биоинформ., 2015, том 10, выпуск 2, страницы 562–566 (Mi mbb244)

Математическое моделирование

Об оценке свободной энергии на основе расчетов динамики в полуклассической модели Холстейна

В. Д. Лахно, Н. С. Фиалко

Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт математических проблем биологии Российской академии наук, Пущино, Россия

Аннотация: В статье рассмотрены два способа нахождения свободной энергии, использующие термодинамически равновесные характеристики, которые рассчитаны прямым вычислительным экспериментом. Приведены результаты расчетов для однородных нуклеотидных димеров AA, GG и TT. Оба способа дают близкие результаты в области биологически значимых температур.

Ключевые слова: ДНК, димер, уравнение Ланжевена, полная энергия, энтропия.

УДК: 51-73: 53.096

Материал поступил в редакцию 10.11.2015, опубликован 11.12.2015

DOI: 10.17537/2015.10.562



© МИАН, 2024