Применение числовой характеристики строя нуклеотидов в геномах прокариот для реклассификации внутри рода Rickettsia

С целью разработки нового подхода для классификации прокариот геномы представителей семейства Rickettsiaceae были проанализированы с помощью формального анализа строя информационной цепи. Для сравнения геномов использовалась такая числовая характеристика строя, как средняя удалённость. Формальный анализ строя позволяет непосредственно учитывать расположение нуклеотидов в каждой последовательности. Полученные результаты позволили уточнить ранее известную классификацию, выделить внутри рода Rickettsia группу Rickettsia felis располагающуюся между «предковой» группой и группой клещевой пятнистой лихорадки (КПЛ), и группу R. akari на границе между группой КПЛ и родом Orientia. Программное обеспечение для анализа нуклеотидных последовательностей с помощью формального анализа строя находится в свободном доступе по адресу: http://foarlab.org.