RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Математическая биология и биоинформатика // Архив

Матем. биология и биоинформ., 2017, том 12, выпуск 2, страницы 375–384 (Mi mbb300)

Эта публикация цитируется в 3 статьях

Математическое моделирование

Возбуждение мобильных дискретных бризеров в ДНК начальными возмущениями смещений или скоростей нескольких смежных нуклеотидных пар

А. П. Четвериковab, К. С. Сергеевab, В. Д. Лахноa

a Институт математических проблем биологии РАН – филиал ИПМ им. М.В. Келдыша РАН Пущино, Московская область, Россия
b Физический факультет, Саратовский национальный исследовательский государственный университет им. Н.Г. Чернышевского, Саратов, Россия

Аннотация: В рамках модели Пейрарда–Бишопа–Доксуа (ПБД) исследовано возбуждение в ДНК дискретных мобильных бризеров, вызванное возмущением скоростей или координат в небольшой группе смежных нуклеотидных пар, расположенных у одного из закрепленных концов молекулы. Показано, что для эффективного возбуждения устойчивых мобильных бризеров должно быть возмущено небольшое количество частиц, причем возмущения скорости и координат могут быть направлены как от оси молекулы, так и к ее оси. Скорость бризера растет с ростом начальной энергии частиц в нуклеотидных парах, а частота падает.

Ключевые слова: нанобиоэлектроника, ДНК, мобильные дискретные бризеры (МДБ), модель Пейрарда–Бишопа–Доксуа.

УДК: 2013.12.27

Материал поступил в редакцию 28.08.2017, опубликован 01.11.2017

DOI: 10.17537/2017.12.375



© МИАН, 2024