RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Математическая биология и биоинформатика // Архив

Матем. биология и биоинформ., 2015, том 10, выпуск Suppl., страницы t39–t55 (Mi mbb321)

Переводы опубликованных статей

Поиск реликтовых рибонуклеотидных и аминокислотных последовательностей, игравших ключевую роль в формировании рибосомы и современного разнообразия белков

Н. Э. Скобликовa, А. А. Зиминb

a Северо-Кавказский научно-исследовательский институт животноводства, Краснодар, 350055, Россия
b Институт биохимии и физиологии микроорганизмов им. Г.К. Скрябина, Российская академия наук, Пущино, Московская область, 142290, Россия

Аннотация: Представлены результаты анализа базы данных белковых последовательностей прокариотических микроорганизмов, выявившего наличие элементов консервативной пептидной последовательности длиной 11 аминокислотных остатков в 20 локусах 16 функционально и филогенетически различных консервативных белков у представителей различных таксонов. Этот аминокислотный мотив IKAVRELGLER, возможно, является одним из последних общих предшественников матрично-синтезируемых пептидов (Last Universal Peptide Ancestors, LUPAs). Источником генетической информации такой последовательности, по всей вероятности, служит фрагмент рибосомной РНК (участок A-сайта, включающий ветви H92, H90 и H93 пептидил-трансферазного центра), транслированный с одной из возможных рамок считывания. Такой фрагмент рРНК, исполнявший функцию матрицы для синтеза LUPA, назван нами последним общим РНК-предшественником (Last Universal RiboNucleic Ancestor, LURNA). Предполагается, что LURNA и транслируемые с него пептидные продукты послужили источником формирования современного разнообразия пептидов.

Ключевые слова: рибосома, рибосомная РНК, трансляция, пептидил-трансферазный центр, универсальный пептидный мотив, Last Universal Peptide Ancestor, LUPA, Last Universal RiboNucleic Ancestor, LURNA.

УДК: 577.217.347

Материал поступил в редакцию 02.04.2015, опубликован 15.04.2015

DOI: 10.17537/2015.10.t39



© МИАН, 2024