RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Математическая биология и биоинформатика // Архив

Матем. биология и биоинформ., 2020, том 15, выпуск 2, страницы 396–415 (Mi mbb438)

Эта публикация цитируется в 1 статье

Математическое моделирование

Рациональный дизайн потенциальных ингибиторов Bcr-Abl тирозинкиназы методами молекулярного моделирования

А. М. Андриановa, Ю. В. Корноушенкоa, А. Д. Карпенкоb, И. П. Боськоb, Ж. В. Игнатовичc, Е. В. Королеваc

a Институт биоорганической химии, Национальная академия наук Беларуси, Минск, Республика Беларусь
b Объединенный институт проблем информатики, Национальная академия наук Беларуси, Минск, Республика Беларусь
c Институт химии новых материалов НАН Беларуси, Минск, Республика Беларусь

Аннотация: Открытие природы ингибирования опухолевых процессов малыми органическими молекулами изменило принципы разработки лекарственных соединений для противоопухолевой терапии. Последние достижения в этой области связаны с созданием низкомолекулярных ингибиторов протеинкиназ – органических соединений, проявляющих направленное патогенетическое действие. В настоящей работе осуществлен in silico дизайн 38 потенциальных ингибиторов протеинкиназ с мультикиназным профилем на основе производных 2-ариламинопиримидина. Методами молекулярного моделирования оценен потенциал их ингибиторной активности в отношении нативной и мутантной (T$_{315I}$) Bcr-Abl тирозинкиназы – фермента, играющего ключевую роль в патогенезе хронического миелоидного лейкоза, характеризующегося неконтролируемым ростом миелоидных клеток в периферической крови и костном мозге. В результате выполненных исследований идентифицированы 5 соединений-лидеров, проявляющих, согласно расчетным данным, высокую аффинность связывания с нативной и мутантной Abl-киназой. Показано, что сконструированные методами молекулярного моделирования соединения представляют собой перспективные базовые структуры для разработки новых эффективных противоопухолевых препаратов.

Ключевые слова: протеинкиназы, Bcr-Abl тирозинкиназа, ингибиторы Bcr-Abl тирозинкиназы, компьютерный дизайн лекарств, фармакофорное моделирование, молекулярный докинг, квантовая химия, молекулярная динамика.

Материал поступил в редакцию 04.11.2020, 04.12.2020, опубликован 09.12.2020

DOI: 10.17537/2020.15.396



© МИАН, 2024