RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Математическая биология и биоинформатика // Архив

Матем. биология и биоинформ., 2022, том 17, выпуск 2, страницы 174–187 (Mi mbb484)

Биоинформатика

Additional pathogenic pathways in RBCK1 deficiency

[Дополнительные пути патогенеза RBCK1 дефицита]

E. I. Demichevaab, Kh. Shinwarib, K. S. Usheninab, M. A. Bolkovab

a Institute of Immunology and Physiology, Ekaterinburg, Russia
b Ural Federal University, Ekaterinburg, Russia

Аннотация: RBCK1 дефицит – редкое врожденное наследственное заболевание аутовоспалительной природы, которое вызывает нарушение воспалительных процессов на молекулярном уровне. Данное заболевание имеет три основных клинических проявления: повышенную чувствительность к бактериальным инфекциям, синдром аутовоспаления и накопление амилопектина в скелетных мышцах. Амилопектиноз вызывает миопатию и кардиомиопатию. Патогенез заболевания мало изучен и может включать незамеченные взаимосвязи. В данной работе был проведен анализ дифференциальной экспрессии генов у пациентов с RBCK1 дефицитом и тремя другими аутовоспалительными заболеваниями. Идентификация дифференциально экспрессированных генов выявила большое число генов с пониженной экспрессией, которые вовлечены в активацию ключевых метаболических и имунных путей, включающих Nf-kb и Pi3k-Akt-mTOR. Сигнальные пути были проанализированы с использованием KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) и ресурса Gene Ontology. Предсказанные белок-белковые взаимодействия были получены из STRING (Search Tool for the Retrieval of Interacting proteins database). Помимо первичного вовлечения в патологию RBCK1 дефицита, некоторые пути пониженной регуляции усиливают симптомы миопатии, кардиомиопатии и бактериальных заболеваний. Изученные сигнальные пути могут служить новыми мишенями в разработке компенсаторной терапии для пациентов с RBCK1 дефицитом.

Ключевые слова: профилирование генетической экспрессии, аутовоспалительные заболевания, RBCK1, сигнальные пути, белок-белковые взаимодействия.

Материал поступил в редакцию 24.06.2022, 17.07.2022, опубликован 09.08.2022

Язык публикации: английский

DOI: 10.17537/2022.17.174



Реферативные базы данных:


© МИАН, 2024