RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Математическая биология и биоинформатика // Архив

Матем. биология и биоинформ., 2023, том 18, выпуск 1, страницы 89–104 (Mi mbb510)

Эта публикация цитируется в 3 статьях

Математическое моделирование

Modeling of bacterial communication in the extended range of population dynamics

[Моделирование процесса коммуникации бактерий в расширенном диапазоне популяционной динамики]

Y. Shuaia, A. G. Maslovskayaa, C. Kuttlerb

a Amur State University, Blagoveshchensk, Russia
b Technical University of Munich, Garching, Germany

Аннотация: “Чувство кворума”, представляющее один из видов бактериальной коммуникации, может быть исследовано с использованием средств и методов математического и компьютерного моделирования. В настоящей работе предложена модификация детерминированной математической модели бактериального чувства кворума с учетом закона многофазной динамики популяций. Математическая модель формализована в виде начально-краевой задачи для системы полулинейных уравнений в частных производных типа “реакция-диффузия”. Динамика изменения плотности биомассы учтена в генерационных слагаемых модельных уравнений. Модель описывает изменение концентрации специальных химических субстанций – сигнального вещества и фермента лактоназы, характеризующих чувство кворума у грамотрицательных бактерий. Задача решается методом конечных элементов с использованием платформы COMSOL Multiphysics. Проведены вычислительные эксперименты по оценке концентраций ключевых веществ, характеризующих чувство кворума, для бактериального вида Pseudomonas putida в расширенном диапазоне динамики популяции.

Ключевые слова: бактериальная коммуникация, чувство кворума, модель реакции-диффузии, бактериальная динамика, конечно-элементное моделирование, моделирование распределения химических соединений.

Материал поступил в редакцию 11.11.2022, 09.03.2023, опубликован 29.03.2023

Язык публикации: английский

DOI: 10.17537/2023.18.89



© МИАН, 2024