RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Математическая биология и биоинформатика // Архив

Матем. биология и биоинформ., 2011, том 6, выпуск 1, страницы 23–38 (Mi mbb63)

Эта публикация цитируется в 1 статье

Материалы Международной конференции «Математическая биология и биоинформатика»

Electronic structure of the active site of truncated hemoglobin $\mathrm N$ in MCSCF approach

[Электронная структура активного центра усеченного гемоглобина $\mathrm N$ в многоконфигурационном методе самосогласованного поля]

K. V. Simon, A. V. Tulub

Saint-Petersburg State University

Аннотация: В приближении многоконфигурационного метода самосогласованного поля (МКССП) выполнен расчет электронных свойств и оптимальной геометрии активного центра гемма $\mathrm{trHbN}$ с включением в состав системы функциональной группы ($\mathrm{ONOO}$) и двух молекул воды. В качестве стартовых молекулярных орбиталей (МО) использованы локализованные МО. В волновой функции метода МКССП заданы два подпространства полного взаимодействия (CAS), это подпространство 3d-орбиталей атома железа и подпространство связывающих и разрыхляющих МО в пероксинитрите плюс орбиталь одной неподеленной электронной пары на фрагменте $\mathrm O_2$. Геометрия анионных структур $\mathrm{(ONOO)}^-$, возникающих в результате переноса заряда с $\mathrm{Fe(II)}$, близка к структурам нитратного аниона и пероксинитрита в газовой фазе. Пероксинитритная структура рассмотрена в двух различных спиновых состояниях, которые соответствуют синглетному и триплетному состояниям этого аниона в газовой фазе. Обсуждается возможная роль пероксинитритной структуры в связи с защитной реакцией M. tuberculosis.

Ключевые слова: защитная реакция бациллы туберкулеза, электронная структура активного центра гемма, волновые функции многоконфигурационного метода самосогласованного поля (МКССП).

Материал поступил в редакцию 30.12.2010, опубликован 31.01.2011

Язык публикации: английский



© МИАН, 2024