Эта публикация цитируется в
1 статье
Материалы Международной конференции «Математическая биология и биоинформатика»
Electronic structure of the active site of truncated hemoglobin $\mathrm N$ in MCSCF approach
[Электронная структура активного центра усеченного гемоглобина
$\mathrm N$ в многоконфигурационном методе самосогласованного поля]
K. V. Simon,
A. V. Tulub Saint-Petersburg State University
Аннотация:
В приближении многоконфигурационного метода самосогласованного поля (МКССП) выполнен расчет электронных свойств и оптимальной геометрии активного центра гемма
$\mathrm{trHbN}$ с включением в состав системы функциональной группы (
$\mathrm{ONOO}$) и двух молекул воды. В качестве стартовых молекулярных орбиталей (МО) использованы локализованные МО. В волновой функции метода МКССП заданы два подпространства полного взаимодействия (CAS), это подпространство 3d-орбиталей атома железа и подпространство связывающих и разрыхляющих МО в пероксинитрите плюс орбиталь одной неподеленной электронной пары на фрагменте
$\mathrm O_2$. Геометрия анионных структур
$\mathrm{(ONOO)}^-$, возникающих в результате переноса заряда с
$\mathrm{Fe(II)}$, близка к структурам нитратного аниона и пероксинитрита в газовой фазе. Пероксинитритная структура рассмотрена в двух различных спиновых состояниях, которые соответствуют синглетному и триплетному состояниям этого аниона в газовой фазе. Обсуждается возможная роль пероксинитритной структуры в связи с защитной реакцией
M. tuberculosis.
Ключевые слова:
защитная реакция бациллы туберкулеза, электронная структура активного центра гемма, волновые функции многоконфигурационного метода самосогласованного поля (МКССП).
Материал поступил в редакцию 30.12.2010,
опубликован 31.01.2011
Язык публикации: английский