Моделирование движения частиц в масс-спектрометре с помощью параллельного кода частиц в ячейке

В настоящее время масс-спектрометры являются основными инструментами, используемыми в протеомике. При этом на точность измерения масс биомолекул оказывает влияние кулоновское взаимодействие анализируемых частиц друг с другом и со стенками ионной ловушки. Работа посвящена разработке трехмерного кода моделирования динамики взаимодействующих частиц в масс-спектрометре ионного циклотронного резонанса с преобразованием Фурье. Приводится математическая постановка задачи, схема метода решения, осуществлен анализ ускорения параллельной программы. Расчеты выполнены на системе IBM eServer pSeries 690 Regatta (факультет ВМК МГУ).