RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Математическое моделирование // Архив

Матем. моделирование, 2012, том 24, номер 10, страницы 98–108 (Mi mm3324)

Эта публикация цитируется в 4 статьях

О некоторых новых характеристиках больших геномов

Н. Н. Козлов

Институт прикладной математики им. М. В. Келдыша РАН, Москва

Аннотация: В работе представлены результаты расчетов для некоторых новых характеристик больших геномов. Проанализировано 12 геномов с общим числом генов 203 942. Работа основывается на теоретических исследованиях по блокировке генов, опубликованных в 2010 году в данном журнале. Расчеты показали, что для всех геномов блокировка не является случайной, не является экстремальной. Для генома человека ее среднее значение более чем втрое меньше теоретического максимального и в 2.5 раз больше теоретического минимального значения. Показано, что плюс и минус цепи ДНК блокированы практически одинаково для всех изученных геномов. Установлено не равновероятное участие кодонов терминации в блокировках. Для почти всех рассмотренных геномов кодон TGA использован более 50% по сравнению с ТАА и ТАG. Актуальность данной работе придает то обстоятельство, что на сентябрь 2011 г. в мире проводятся исследования по расшифровке более 1200 больших геномов.

Ключевые слова: большие геномы, блокировка генов.

УДК: 519.72

Поступила в редакцию: 22.09.2011


 Англоязычная версия: Mathematical Models and Computer Simulations, 2013, 5:3, 220–228

Реферативные базы данных:


© МИАН, 2024