RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Математическое моделирование // Архив

Матем. моделирование, 2014, том 26, номер 12, страницы 3–13 (Mi mm3550)

Эта публикация цитируется в 1 статье

Эффективный поиск возможных взаимных расположений двух твердых тел с использованием обобщенного пятимерного преобразования Фурье

А. М. Казённовa, А. Е. Алексеенкоa, Д. Козаковb, Д. Н. Подгорныйa, Я. А. Холодовa

a Московский физико-технический институт (государственный университет), кафедра вычислительной математики, Россия
b Biomedical Engineering, Boston University, USA

Аннотация: Предлагается новый эффективный алгоритм поиска оптимального расположения двух твердых тел. Такая задача часто возникает при рассмотрении проблемы совмещения трехмерных форм, например, в белок-белковом докинге. В основе предложенного метода лежит полный перебор взаимных расположений в пространстве радиально-сферических функций, осуществляемый при помощи обобщенного пятимерного преобразования Фурье. Основным преимуществом описанного метода является эффективность расчета при использовании многокомпонентных оценочных функций, что позволяет достичь высокого качества при низких временных затратах.

Ключевые слова: обобщенное преобразование Фурье, быстрое преобразование Фурье, сферическое преобразование Фурье, сферические функции, радиальные гармоники, свертка, совмещение трехмерных форм, докинг.

УДК: 004.42+519.6+577.2

Поступила в редакцию: 21.11.2013


 Англоязычная версия: Mathematical Models and Computer Simulations, 2015, 7:4, 315–322

Реферативные базы данных:


© МИАН, 2024