Алгебраические аспекты теории операд. Многообразия алгебр над операдами. Связи теории операд с теорией категорий. Эквивалентность Мориты для колец и для операд. Категории и кольца частных. Проективные модули и алгебры. Приложения теории операд к теории графов, представлений и теории кодирования. Алгебраическая криптография.
Основные публикации:
Тронин С. Н. О коммутативных ассоциативных проективных алгебрах ранга 2 над совершенным полем // Математические заметки. 1987. Т. 41, вып. 6. С. 776–780.
Тронин С. Н. Произведения в категориях частных и универсальное обращение гомоморфизмов // Математический сборник. 1997. Т. 188, № 10. С. 109–130.
Тронин С. Н. Ретракты и ретракции свободных алгебр // Известия вузов. Математика. 1998. № 1. С. 67–78.
Тронин С. Н. О Морита-контекстах, возникающих при изоморфизме некоторых подколец колец эндоморфизмов // Известия вузов. Математика. 1997. № 8. С. 50–58.
Тронин С. Н., Копп О. А. Матричные линейные операды // Известия вузов. Математика. 2000. № 6. С .53–62.