|
СЕМИНАРЫ |
Семинар отдела дискретной математики МИАН
|
|||
|
Биоинформатика и поиск сдвигов рамки считывания в генах Е. В. Коротков Центр "Биоинженерия" РАН |
|||
Аннотация: Кратко рассматриваются основные задачи, стоящие перед биоинформатикой, в частности: – анализ нуклеотидных и аминокислотных последовательностей, – предсказание белковых структур на основе знания аминокислотных последовательностей, – изучение данных, полученных при помощи биочипов, – создание динамических моделей генетических сетей. В качестве примера решаемой задачи рассматривается поиск мутаций в генах посредством сдвига рамки считывания и разработка математических методов для их идентификации. Для поиска сдвигов рамки считывания введено понятие сдвига фазы триплетной периодичности нуклеотидной последовательности и предложен математический алгоритм для его выявления. При изучении последовательностей генов из банка данных Kegg-46 было выявлено 27417 тысяч генов (0,7% от общего их числа в базе данных Kegg), имеющих сдвиг фазы триплетной периодичности. |