Аннотация:
Технологии высокопроизводительного секвенирования ДНК позволяют получать данные экспрессии генов в масштабе генома, как на микрочипах, так и на основе транскриптомного профилирования. Необходимо развитие новых компьютерных методов анализа таких данных, опирающихся на суперкомпьютерные технологии. Рассмотрены задачи анализа транскриптом в контексте вычислительной сложности. Представлены примеры применения программного комплекса ExpGene для статистической обработки и визуализации транскриптомных и микрочиповых данных. Показаны приложения для анализа транскриптом отделов мозга лабораторных животных.
Ключевые слова и фразы:
биоинформатика, программный комплекс, секвенирование ДНК, транскриптом, экспрессия генов, микрочипы, базы данных.
УДК:
57.05; 004.031.2
Поступила в редакцию: 17.04.2017 Подписана в печать : 15.05.2017