Молекулярное моделирование и расчеты свободных энергий связывания белков и биологически активных соединений

Численные расчеты структуры и термодинамики микроскопических моделей с использованием вычислительных машин — эффективный инструмент для изучения молекулярных механизмов биохимических процессов и реакционной способности физиологически активных соединений. В обзоре рассмотрены статистико-механические методы расчета свободных энергий равновесных систем. Освещены технические приемы, повышающие эффективность подобных вычислений. Приведены примеры расчетов термодинамических характеристик связывания в модельных комплексах белок–лиганд для лизоцима бактериофага $\mathrm{T}4$ и $\beta$-трипсина. Обсуждены роль и возможности методов молекулярного моделирования в современных исследованиях по разработке новых лекарственных средств.
Библиография — 237 ссылок.