RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Системы и средства информатики // Архив

Системы и средства информ., 2008, спецвыпуск, страницы 86–111 (Mi ssi158)

On linguistic classification of bacterial genomes

[Об лингвистической классификации геномов бактерий]

Zeev Volkovicha, Valery Kirzhnerb, Zeev Barzilya

a Software Engineering Department, ORT Braude College of Engineering, Karmiel, Israel
b Institute of Evolution, University of Haifa, Haifa, Israel

Аннотация: Данная статья посвящена классификации 185 полных геномов прокариот на основе модифицированного метода составного спектра. Эта модификация предполагает раздельное вычисление спектра для кодирующей и не кодирующей частей генома. Такой подход позволяет выбрать количество кластеров для классификации геномов, не используя дополнительной информации. Биологический смысл классификации, найденной на основе двух- и четырехбуквенных алфавитов, подтверждает правильность полученных результатов.

Язык публикации: английский



© МИАН, 2024