RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Труды института системного программирования РАН // Архив

Труды ИСП РАН, 2022, том 34, выпуск 1, страницы 161–172 (Mi tisp672)

Решение проблемы хранения траекторий молекулярной динамики в СУБД

И. В. Лихачев

Институт математических проблем биологии РАН— филиал ИПМ им. М.В. Келдыша РАН

Аннотация: В работе решается проблема хранения траекторий молекулярной динамики в реляционных и нереляционных базах данных. Традиционный подход организации структуры реляционных таблиц не подходит для хранения траекторий ввиду появления большого числа записей в одной таблице. Описано, каким образом можно структурировать данные в СУБД класса NoSQL. Затем эти идеи переносятся на реляционную СУБД MySQL.

Ключевые слова: СУБД, SQL, NoSQL, MongoDB, MySQL, моделирование молекулярной динамики, траектории молекулярной динамики, TAMD, анализатор траекторий молекулярной динамики, большие данные.

DOI: 10.15514/ISPRAS-2022-34(1)-12



© МИАН, 2024