Аннотация:
Показано, что $p$-адические модели ультраметрической диффузии можно использовать для описания конформационной динамики макромолекул и химической кинетики, обусловленной макромолекулярной динамикой. Изложенный в работе подход основан на использовании иерархического приближения в описании динамики на многомерных сильно пересеченных энергетических ландшафтах и в $p$-адическом описании динамики макромолекул в терминах переходов между бассейнами состояний. Показано, что ультраметрические модели позволяют описать характерные типы релаксации в макромолекулярных системах, а именно закон Кольрауша, закон степенного распада и закон логарифмического распада, в рамках единого подхода. Построена и исследована $p$-адическая модель ультраметрической диффузии с реакционным стоком. Данная модель использована для описания кинетики связывания CO миоглобином, и продемонстрировано соответствие теоретических результатов экспериментально наблюдаемым особенностям кинетики связывания.