Д. А. Желтков, И. В. Офёркин, Е. В. Каткова, А. В. Сулимов, В. Б. Сулимов, Е. Е. Тыртышников, “TTDock: метод докинга на основе тензорных поездов”, Выч. мет. программирование, 2013, том 14, выпуск 3,страницы 279

Эта публикация цитируется в 3 статьях

Вычислительные методы и приложения

TTDock: метод докинга на основе тензорных поездов

Д. А. Желтков^a, И. В. Офёркин^b, Е. В. Каткова^b, А. В. Сулимов^b, В. Б. Сулимов^c, Е. Е. Тыртышников^d

^a Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, факультет вычислительной математики и кибернетики
^b ООО "Димонта"
^c Научно-исследовательский вычислительный центр, Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова
^d Институт вычислительной математики РАН

Аннотация: Разработан метод докинга на основе тензорных поездов, позволяющий с высокой вероятностью найти положение, в котором достигается глобальный минимум энергии системы белок-лиганд. Полученный метод сравнивается с одним из наиболее эффективных методов докинга на основе генетических алгоритмов SOL. Результаты тестирования показывают, что метод на основе тензорных поездов в 10 раз менее затратен при сопоставимой надежности получения глобального оптимума энергии.

Ключевые слова: тензорный поезд; крестовый метод; глобальная оптимизация; докинг; компьютерный дизайн лекарств.

УДК: 519.6

Поступила в редакцию: 09.05.2013