Расчеты взаимодействий в биомолекулярных системах: сравнение квантовых и классических подходов

Рассматриваются методические вопросы применения методов молекулярной механики, квантовой химии и комбинированного метода квантовой механики/молекулярной механики (КМ/ММ) к расчетам межмолекулярных взаимодействий ряда аминокислот (аргинина, гистидина и серина) с молекулами воды. Расчеты выполнены на суперкомпьютере СКИФ МГУ “Чебышeв” с использованием приближений теории функционала электронной плотности в квантовых подсистемах. По результатам расчетов сформулированы практические рекомендации для оценок энергетической стабильности межмолекулярных комплексов. Работа выполнена при поддержке РФФИ (код проекта 10-01-00297а).