RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Вестник Южно-Уральского государственного университета. Серия «Вычислительная математика и информатика» // Архив

Вестн. ЮУрГУ. Сер. Выч. матем. информ., 2017, том 6, выпуск 4, страницы 74–90 (Mi vyurv179)

Эта публикация цитируется в 2 статьях

Суперкомпьютерное моделирование

Гибридные вычислительные кластеры для изучения структуры, функции и регуляции белков

Д. А. Суплатов, Н. Н. Попова, К. Е. Копылов, М. В. Шегай, Вл. В. Воеводин, В. К. Швядас

Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова (119991 Москва, Ленинские Горы, д. 1)

Аннотация: Изучение структуры, функции и регуляции белков с использованием биоинформатики и молекулярного моделирования является комплексной задачей, требующей сочетания различных методов и способов их исполнения. На практике, речь идет о конвейере из последовательных этапов, исполняемых различными программами, предъявляющими свои требования к вычислительным ресурсам. Гибридные вычислительные кластеры – системы, обладающие существенной мощностью и разнообразием аппаратных возможностей – необходимы для того, чтобы оптимально исполнить каждую отдельную стадию единого комплексного решения. При этом GPU-ускорители открывают новые возможности для поиска эффективных решений ресурсоемких задач биоинформатики и молекулярного моделирования.

Ключевые слова: гибридные вычислительные кластеры, биоинформатика, молекулярное моделирование, последовательные этапы, кодизайн, GPU-ускорители.

УДК: 004.021, 620.186

Поступила в редакцию: 11.09.2017

DOI: 10.14529/cmse170406



Реферативные базы данных:


© МИАН, 2024