RUS  ENG
Полная версия
ЖУРНАЛЫ // Компьютерные исследования и моделирование

Компьютерные исследования и моделирование, 2013, том 5, выпуск 1, страницы 65–81 (Mi crm382)

Сопряжение различных методов компьютерного моделирования в комплексной модели фотосинтетической мембраны
Д. М. Устинин, И. Б. Коваленко, Г. Ю. Ризниченко, А. Б. Рубин

Список литературы (References)

1. А. М. Абатурова, И. Б. Коваленко, Г. Ю. Ризниченко, А. Б. Рубин, “Исследование образования комплекса флаводоксина и фотосистемы 1 методами прямого многочастичного компьютерного моделирования”, Компьютерные исследования и моделирование, 1 (2009), 85–91  mathnet  elib
2. А. В. Вершубский, В. И. Приклонский, А. Н. Тихонов, “Математическая модель электронного и протонного транспорта в фотосинтетических системах оксигенного типа”, Росcийский химический журнал, LI (2007)
3. И. Б. Коваленко, А. М. Абатурова, Г. Ю. Ризниченко, А. Б. Рубин, “Новый метод компьютерного моделирования образования белок-белковых комплексов”, Доклады Академии наук, 427 (2009), 696–698  mathnet  zmath  elib
4. Г. В. Лебедева, Н. Е. Беляева, Г. Ю. Ризниченко, и др., “Кинетическая модель фотосистемы II высших растений”, Журнал физической химии, 74 (2000), 1874–1883
5. A. T. Мокроносов, В. Ф. Гавриленко, Фотосинтез. Физиолого-экологические и биохимические аспекты, Изд-во МГУ, Москва, 1992
6. Г. Ю. Ризниченко, Н. Е. Беляева, И. Б. Коваленко, А. Б. Рубин, “Математическое и компьютерное моделирование первичных процессов фотосинтеза”, Биофизика, 54 (2009), 16–33  elib
7. А. Н. Тихонов, Л. А. Блюменфельд, “Концентрация водородных ионов в в субклеточных частицах: физический смысл и методы определения”, Биофизика, 30 (1985), 527–537
8. Д. М. Устинин, И. Б. Коваленко, Е. А. Грачев, и др., “Метод прямого многочастичного компьютерного моделирования фотосинтетической электронно-транспортной цепи”, Динамические модели процессов в клетках и субклеточных наноструктурах, 2010, 241–262
9. P. A. Albertsson, “A quantitative model of the domain structure of the photosynthetic membrane”, Trends in Plant Science, 6 (2001), 349–354  crossref  scopus
10. W. Chow, A. B. Hope, “Kinetics of reactions around the cytochrome bf complex studied in intact leaf disks”, Photosynthetic Research, 81 (2004), 153–163  crossref  scopus
11. F. De Rienzo, R. R. Gabdoulline, M. C. Menziani, et al., “Electrostatic analysis and Brownian dynamics simulation of the association of plastocyanin and cytochrome f”, Biophysical Journal, 81 (2001), 3090–3104  crossref  adsnasa  scopus
12. E. L. Gross, “Plastocyanin: structure, location, diffusion and electron transfer mechanisms”, Biochemistry and Molecular Biology of Plants, ed. R. Jones, Kluwer Academic Publishers, 1996, 413–429
13. E. L. Gross, Jr. D. C. Pearson, “Brownian Dynamics Simulations of the Interaction of Chlamydomonas Cytochrome f with Plastocyanin and Cytochrome c6”, Biophysical Journal, 85 (2003), 2055–2068  crossref  adsnasa  scopus
14. A. B. Hope, “The chloroplast cytochrome bf complex: a critical focus on function”, Biochim. Biophys. Acta, 1143 (1993), 1–22  crossref  scopus
15. A. B. Hope, “Electron transfers amongst cytochrome f, plastocyanin and photosystem I: kinetics and mechanisms”, Biochim. Biophys. Acta, 1456 (2000), 5–26  crossref  scopus
16. M. Mehta, V. Sarafis, C. Critchley, “Thylakoid membrane architecture”, Australian Journal of Plant Physiology, 26 (1999), 709–716  crossref  scopus
17. D. C. Pearson, E. L. Gross, “Brownian dynamics study of the interaction between plastocyanin and cytochrome f”, Biophysical Journal, 75 (1998), 2698–2711  crossref  adsnasa  scopus
18. G. Y. Riznichenko, I. B. Kovalenko, A. M. Abaturova, et al., “New direct dynamic models of protein interactions coupled to photosynthetic electron transport reactions”, Biophysical Reviews, 2 (2010), 101–110  crossref  elib  scopus
19. A. B. Rubin, G. Y. Riznichenko, “Models of primary processes in a photosynthetic membrane”, Advances in Photosynthesis and respiration, 29 (2009), 151–176  crossref
20. A. Stirbet, Govindjee, B. J. Strasser, R. J. Strasser, “Chlorophylla Fluorescence Induction in Higher Plants: Modelling and Numerical Simulation”, Journal of Theoretical Biology, 193 (1998), 131–151  crossref  scopus
21. M. Ubbink, M. Ejdeback, G. B. Karlsson, D. S. Bendall, “The structure of the complex of plastocyanin and cytochrome f, determined by paramagnetic NMR and restrained rigid-body molecular dynamics”, Structure, 6 (1998), 323–335  crossref  scopus
22. G. M. Ullmann, E.-W. Knapp, N. M. Kostic, “Computational Simulation and Analysis of Dynamic Association between Plastocyanin and Cytochrome f. Consequences for the Electron-Transfer Reaction”, Journal of American Chemical Society, 119 (1997), 42–52  crossref


© МИАН, 2025