RUS  ENG
Полная версия
СЕМИНАРЫ

Большой семинар кафедры теории вероятностей МГУ
21 ноября 2007 г. 16:45, г. Москва, ГЗ МГУ, ауд. 16-24


Теория кодирования ДНК последовательностей

А. Г. Дьячков

Московский государственный университет имени М. В. Ломоносова

Аннотация: ДНК последовательностями называются последовательности длины n из букв алфавита {A,C,G,T}. В молекулярной биологии ДНК последовательности представляют собой одиночные направленные молекулы ДНК, т.е. цепочки, составленные из 4 типов нуклеиновых кислот (оснований), обозначаемых буквами указанного алфавита. Пары букв-оснований (A,T) и (C,G) образуют водородные связи и называются взаимно комплементарными. Свойством одиночных молекул ДНК является их способность срастаться в пары (дуплексы) путем соединения между собой комплементарных оснований. Процесс образования дуплекса называется гибридизацией. При этом наиболее устойчивые (с максимальной энергией гибридизации) дуплексы, называемые дуплексами Ватсона-Крика (ВК-дуплексы), образуются из противоположно направленных молекул с взаимно комплементарными основаниями. ДНК кодом называется множество ДНК последовательностей, для которых формирование ВК-дуплексов энергетически существенно благоприятнее, чем формирование не ВК-дуплексов. Для биологических приложений, использующих гибридизацию молекул ДНК, могут понадобиться ДНК коды, состоящие из ДНК последовательностей длины $n$ порядка 10-40, а число ДНК последовательностей достигает $10^9$. В докладе обсуждаются теоретико-вероятностные и комбинаторные методы теории кодирования для исследования ДНК кодов.


© МИАН, 2024