Аннотация:
В рамках данной работы была продемонстрирована возможность использования характеристик профилей электростатического потенциала вдоль последовательностей ДНК для определения их функционального класса. Построены модели, позволяющие разделять промоторные и непромоторные последовательности (случайные бернуллиевские, кодирующие и псевдопромоторы) с точностью порядка 83-85 %. Определены наиболее значимые участки для такого разделения, по-видимому играющие важную роль при ДНК-полимеразном узнавании.
Ключевые слова:электростатические свойства ДНК, поиск промоторов, VIP-анализ.
УДК:519.8
Поступила в редакцию: 16.09.2013 Исправленный вариант: 26.01.2015